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核糖核酸
來(lái)源:互聯(lián)網(wǎng)

核糖核酸(RNA)是一種由核糖核苷酸聚合而成的線性大分子,存在于生物細(xì)胞和部分病毒、類病毒中的遺傳信息載體。RNA的堿基主要有4種,即腺嘌呤(A)、鳥嘌呤(G)、胞嘧啶(C)和尿嘧啶(U),其中尿取代了DNA中的胸腺嘧啶(T)。RNA在細(xì)胞生物中有多種功能,可在遺傳編碼、轉(zhuǎn)譯、調(diào)控、基因表達(dá)等過(guò)程中發(fā)揮作用。RNA可分為多種類型,如mRNA、tRNA、rRNA和sRNA等。RNA通常由DNA經(jīng)由轉(zhuǎn)錄生成,廣泛分布于真核生物的細(xì)胞核、細(xì)胞質(zhì)、粒線體中。RNA在體內(nèi)的作用主要是引導(dǎo)蛋白質(zhì)的合成,其中mRNA為遺傳訊息的傳遞者,tRNA在轉(zhuǎn)譯過(guò)程中起轉(zhuǎn)運(yùn)RNA的作用,rRNA于轉(zhuǎn)譯過(guò)程中起催化肽鏈形成的作用,sRNA起到調(diào)控基因表達(dá)的作用。此外,RNA病毒甚至以RNA作為它們的遺傳物質(zhì)。RNA分子在細(xì)胞內(nèi)也可以通過(guò)催化生化反應(yīng)、調(diào)控基因表達(dá)或感知和傳遞細(xì)胞信號(hào)等方式發(fā)揮生理功能。RNA和脂質(zhì)、蛋白質(zhì)和碳水化合物一起構(gòu)成了生命體系中四種主要的大分子。

分類

RNA是以脫氧核糖核酸的一條鏈為模板,以堿基互補(bǔ)配對(duì)原則,轉(zhuǎn)錄而形成的一條單鏈,主要功能是實(shí)現(xiàn)遺傳信息在蛋白質(zhì)上的表達(dá),是遺傳信息傳遞過(guò)程中的橋梁。轉(zhuǎn)運(yùn)RNA的功能是攜帶符合要求的氨基酸,以mRNA為模板,合成蛋白質(zhì)。

RNA由核糖核苷酸經(jīng)磷鍵縮合而成長(zhǎng)鏈狀分子。一個(gè)核糖核酸分子由磷酸,核糖和堿基構(gòu)成。RNA的堿基主要有4種,即A腺嘌呤,G鳥嘌呤,C胞嘧啶,U尿嘧啶。其中,U尿嘧啶取代了DNA中的T胸腺嘧啶而成為RNA的特征堿基。

mRNA

mRNA的功能就是把脫氧核糖核酸上的遺傳信息精確無(wú)誤地轉(zhuǎn)錄下來(lái),然后再由mRNA的堿基順序決定蛋白質(zhì)的氨基酸順序,完成基因表過(guò)程中的遺傳信息傳遞過(guò)程。在真核生物中,轉(zhuǎn)錄形成的前體RNA中含有大量非編碼序列,大約只有25%序列經(jīng)加工成為mRNA,最后翻譯為蛋白質(zhì)。因?yàn)檫@種未經(jīng)加工的前體mRNA(pre-mRNA)在分子大小上差別很大,所以通常稱為不均一核RNA(heterogeneousnuclearRNA,hnRNA)。

tRNA

如果說(shuō)mRNA是合成蛋白質(zhì)的藍(lán)圖,則核糖體是合成蛋白質(zhì)的工廠。但是,合成蛋白質(zhì)的原材料——20種氨基酸與mRNA的堿基之間缺乏特殊的親和力。因此,必須用一種特殊的RNA——轉(zhuǎn)移RNA(transferRNA,tRNA)把氨基酸搬運(yùn)到核糖體上,tRNA能根據(jù)mRNA的遺傳密碼依次準(zhǔn)確地將它攜帶的氨基酸連結(jié)起來(lái)形成多肽鏈。每種氨基酸可與1-4種tRNA相結(jié)合,已知的tRNA的種類在40種以上。

轉(zhuǎn)運(yùn)RNA是分子最小的RNA,其分子量平均約為27000(25000-30000),由70到90個(gè)核苷酸組成。而且具有稀有堿基的特點(diǎn),稀有堿基除假尿嘧啶核苷與次黃嘌呤核苷外,主要是甲基化了的嘌呤和嘧啶。這類稀有堿基一般是在轉(zhuǎn)錄后,經(jīng)過(guò)特殊的修飾而成的。

1969年以來(lái),研究了來(lái)自各種不同生物,如:如酵母、大腸桿菌、小麥、鼠等十幾種tRNA的結(jié)構(gòu),證明它們的堿基序列都能折疊成三葉草形二級(jí)結(jié)構(gòu),而且都具有如下的共性:

①5’末端具有G(大部分)或C。

②3’末端都以ACC的順序終結(jié)。

③有一個(gè)富有鳥嘌呤的環(huán)。

④有一個(gè)反密碼子環(huán),在這一環(huán)的頂端有三個(gè)暴露的堿基,稱為反密碼子(anticodon).反密碼子可以與mRNA鏈上互補(bǔ)的密碼子配對(duì)。

⑤有一個(gè)胸腺嘧啶環(huán)。

rRNA

核糖體RNA(ribosomalRNA,rRNA)是組成核糖體的主要成分。核糖體是合成蛋白質(zhì)的工廠。在大腸桿菌中,rRNA量占細(xì)胞總RNA量的75%-85%,而轉(zhuǎn)運(yùn)RNA占15%,mRNA僅占3-5%。

rRNA一般與核糖體蛋白質(zhì)結(jié)合在一起,形成核糖體(ribosome),如果把rRNA從核糖體上除掉,核糖體的結(jié)構(gòu)就會(huì)發(fā)生塌陷。原核生物的核糖體所含的rRNA有5S、16S及23S三種。

S為沉降系數(shù)(sedimentationcoefficient),當(dāng)用超速離心測(cè)定一個(gè)粒子的沉淀速度時(shí),此速度與粒子的大小直徑成比例。5S含有120個(gè)核苷酸,16S含有1540個(gè)核苷酸,而23S含有2900個(gè)核苷酸。而真核生物有4種rRNA,它們分子大小分別是5S、5.8S、18S和28S,分別具有大約120、160、1900和4700個(gè)核苷酸。rRNA是單鏈,它包含不等量的A與U、G與C,但是有廣泛的雙鏈區(qū)域。在雙鏈區(qū),堿基因氫鍵相連,表現(xiàn)為發(fā)夾式螺旋。

rRNA在蛋白質(zhì)合成中的功能尚未完全明了。但16S的rRNA3’端有一段核苷酸序列與mRNA的前導(dǎo)序列是互補(bǔ)的,這可能有助于mRNA與核糖體的結(jié)合。

miRNA

MicroRNAs(miRNAs)是在真核生物中發(fā)現(xiàn)的一類內(nèi)源性的具有調(diào)控功能的非編碼RNA,其大小長(zhǎng)約20~25個(gè)核苷酸。成熟的miRNAs是由較長(zhǎng)的初級(jí)轉(zhuǎn)錄物經(jīng)過(guò)一系列核酸酶的剪切加工而產(chǎn)生的,隨后組裝進(jìn)RNA誘導(dǎo)的沉默復(fù)合體,通過(guò)堿基互補(bǔ)配對(duì)的方式識(shí)別靶mRNA,并根據(jù)互補(bǔ)程度的不同指導(dǎo)沉默復(fù)合體降解靶mRNA或者阻遏靶mRNA的翻譯。最近的研究表明miRNA參與各種各樣的調(diào)節(jié)途徑,包括發(fā)育、病毒防御、造血過(guò)程、器官形成、細(xì)胞增殖和凋亡、脂肪代謝等等。

小分子RNA

(small RNA)

存在于真核生物細(xì)胞核細(xì)胞質(zhì)中,它們的長(zhǎng)度為100到300個(gè)堿基(酵母中最長(zhǎng)的約1000個(gè)堿基)。多的每個(gè)細(xì)胞中可含有105~106個(gè)這種RNA分子,少的則不可直接檢測(cè)到,它們由RNA聚合酶Ⅱ或RNA聚合酶Ⅲ所合成,其中某些像mRNA一樣可被加帽

主要有兩種類型的小分子RNA:一類是snRNA(small nuclear RNA),存在于細(xì)胞核中;另一類是scRNA(small cytoplasmic RNA),存在于細(xì)胞質(zhì)中。

小分子RNA通常與蛋白質(zhì)組成配位化合物,在細(xì)胞的生命活動(dòng)中起重要的作用。

①snRNA:

snRNA(smallnuclearRNA,小核RNA)。它是真核生物轉(zhuǎn)錄后加工過(guò)程中RNA剪接體(spilceosome)的主要成分。發(fā)現(xiàn)有五種snRNA,其長(zhǎng)度在哺乳動(dòng)物中約為100-215個(gè)核苷酸。snRNA一直存在于細(xì)胞核中,與40種左右的核內(nèi)蛋白質(zhì)共同組成RNA剪接體,在RNA轉(zhuǎn)錄后加工中起重要作用。某些snRNPs和剪接作用密切相關(guān),它們分別與供體和受體剪接位點(diǎn)以及分支順序相互補(bǔ)。

其中位于核仁內(nèi)的snRNA稱為核小體RNA(small uncleolar RNA),參與rRNA前體的加工及核糖體亞基的組裝。

②scRNA:

scRNA(small cytoplasmic RNA,細(xì)胞質(zhì)小RNA)主要位于細(xì)胞質(zhì)內(nèi),種類較多,參與蛋白質(zhì)的合成和運(yùn)輸。SRP顆粒就是一種由一個(gè)7SRNA和六種蛋白質(zhì)組成的核糖核蛋白體顆粒,主要功能是識(shí)別信號(hào)肽,并將核糖體引導(dǎo)到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)

端體酶RNA

端體酶RNA(telomeraseRNA),它與染色體末端的復(fù)制有關(guān)。

反義RNA

反義RNA(antisenseRNA),它參與基因表達(dá)的調(diào)控。

上述各種RNA分子均為轉(zhuǎn)錄的產(chǎn)物,mRNA最后翻譯為蛋白質(zhì),而rRNA、轉(zhuǎn)運(yùn)RNA及snRNA等并不攜帶翻譯為蛋白質(zhì)的信息,其終產(chǎn)物就是RNA。

核酶

另外還有一種特別的RNA(其分類與上述RNA分類無(wú)關(guān))——核酶

核酶(ribozyme)一詞用于描述具有催化活性的RNA,即化學(xué)本質(zhì)是核糖核酸(RNA),卻具有酶的催化功能。核酶的作用底物可以是不同的分子,有些作用底物就是同一RNA分子中的某些部位。核酶的功能很多,有的能夠切割RNA,有的能夠切割脫氧核糖核酸,有些還具有RNA連接酶、磷酸酶等活性。與蛋白質(zhì)酶相比,核酶的催化效率較低,是一種較為原始的催化酶。

大多數(shù)核酶通過(guò)催化轉(zhuǎn)磷酸酯磷酸二酯鍵水解反應(yīng)參與RNA自身剪力、加工過(guò)程,也具有特異性,甚至具有Km值。

其發(fā)現(xiàn)是科學(xué)家大腸桿菌RNaseP蛋白在切去部分后,在體外高濃度鎂離子的情況下,留下的RNA部分(MIRNA)具有酶活性。

非編碼RNA

【新型生命暗物質(zhì)】非編碼RNA(核糖核酸),被稱為生命體中“暗物質(zhì)”。日前,中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)單革教授實(shí)驗(yàn)室發(fā)現(xiàn)一類新型環(huán)狀非編碼RNA,并揭示了此類非編碼RNA的功能和功能機(jī)理。成果發(fā)表在國(guó)際知名雜志《自然·結(jié)構(gòu)和分子生物學(xué)》上。非編碼RNA是一大類不編碼蛋白質(zhì),但在細(xì)胞中起著調(diào)控作用的RNA分子。

正如宇宙間存在著許多既看不到也感覺不到的“暗物質(zhì)”“暗能量”一樣,在生命體這個(gè)“小宇宙”中,也存在這樣的神秘“暗物質(zhì)”—非編碼RNA。

越來(lái)越多的證據(jù)表明,一系列重大疾病的發(fā)生發(fā)展與非編碼RNA調(diào)控失衡相關(guān)。

環(huán)形RNA分子最近數(shù)年才引起研究人員注意,而此前的研究主要集中于線性RNA分子。單革教授實(shí)驗(yàn)室發(fā)現(xiàn)的新型環(huán)狀非編碼RNA,被命名為外顯子-內(nèi)含子環(huán)形RNA。在論文中,他們還對(duì)這類新型環(huán)狀非編碼RNA為何會(huì)成為環(huán)形而不是線形分子進(jìn)行了研究,發(fā)現(xiàn)成環(huán)序列兩端經(jīng)常會(huì)有互補(bǔ)的重復(fù)序列存在。

細(xì)胞中的分布

左圖是用吡羅紅甲基綠染色液染色的賴蛤蟆血涂片。

由于脫氧核糖核酸和RNA在化學(xué)組成與分子結(jié)構(gòu)上存在一定的差別,因而對(duì)不同的染料有著不同的反應(yīng)。所以,可以根據(jù)這一反應(yīng)差異來(lái)研究細(xì)胞中DNA與RNA的分布情況。

DNA和RNA兩種核酸分子都是多聚體,但是它們的聚合程度有所不同。DNA聚合程度高,易于甲基綠結(jié)合;RNA聚合程度低易與吡羅紅結(jié)合。所以當(dāng)吡羅紅與甲基綠混在一起作為染料時(shí)吡羅紅與核仁細(xì)胞質(zhì)中的RNA選擇性結(jié)合,從而顯示紅色;甲基綠染色質(zhì)中的DNA選擇性結(jié)合,從而顯示綠色。綜上所述,RNA對(duì)吡羅紅的親和力大,被染成紅色;脫氧核糖核酸對(duì)甲基綠的親和力大,被染成綠色。

組成結(jié)構(gòu)

與DNA不同,RNA一般為單鏈長(zhǎng)分子,不形成雙螺旋結(jié)構(gòu),核糖核酸但是很多RNA也需要通過(guò)堿基配對(duì)原則形成一定的二級(jí)結(jié)構(gòu)乃至三級(jí)結(jié)構(gòu)來(lái)行使生物學(xué)功能。RNA的堿基配對(duì)規(guī)則基本和DNA相同,不過(guò)除了A-U、G-C配對(duì)外,G-U也可以配對(duì)。

細(xì)胞中,根據(jù)結(jié)構(gòu)功能的不同,RNA主要分三類,即轉(zhuǎn)運(yùn)RNA(轉(zhuǎn)運(yùn)RNA),rRNA(核糖體RNA),mRNA(信使RNA)。mRNA是合成蛋白質(zhì)的模板,內(nèi)容按照細(xì)胞核中的脫氧核糖核酸轉(zhuǎn)錄;tRNA是mRNA上堿基序列(即遺傳密碼子)的識(shí)別者和氨基酸的轉(zhuǎn)運(yùn)者;rRNA是組成核糖體的組分,是蛋白質(zhì)合成的工作場(chǎng)所。

細(xì)胞中還有許多種類和功能不一的小型RNA,像是組成剪接體(spliceosome)的snRNA,負(fù)責(zé)rRNA成型的snoRNA,以及參與RNAi作用的miRNA與siRNA等,可調(diào)節(jié)基因表達(dá)。而其他如I、II型內(nèi)含子、RNase P、HDV、核糖體RNA等等都有催化生化反應(yīng)過(guò)程的活性,即具有酶的活性,這類RNA被稱為核酶

在病毒方面,很多病毒只以RNA作為其唯一的遺傳信息載體(有別于細(xì)胞生物普遍用雙鏈脫氧核糖核酸作載體)。

1982年以來(lái),研究表明,不少RNA,如I、II型內(nèi)含子,RNaseP,HDV,核糖體大亞基RNA等等有催化生化反應(yīng)過(guò)程的活性,即具有酶的活性,這類RNA被稱為核酶(核糖核酸催化劑)。

20世紀(jì)90年代以來(lái),又發(fā)現(xiàn)了RNAi(RNAinterference,RNA干擾)等等現(xiàn)象,證明RNA在基因表達(dá)調(diào)控中起到重要作用。

在RNA病毒中,RNA是遺傳物質(zhì),植物病毒總是含RNA。近些年在植物中陸續(xù)發(fā)現(xiàn)一些比病毒還小得多的浸染性致病因子,叫做類病毒。類病毒是不含蛋白質(zhì)的閉環(huán)單鏈RNA分子,此外,真核生物中還有兩類RNA,即不均一核RNA(hnRNA)和小核RNA(snRNA)。hnRNA是mRNA的前體;snRNA參與hnRNA的剪接(一種加工過(guò)程)。自1965年酵母β-氨基酸轉(zhuǎn)運(yùn)RNA堿基序列確定以后,RNA序列測(cè)定方法不斷得到改進(jìn)。除多種tRNA、5SrRNA、5.8SrRNA等較小的RNA外,尚有一些病毒RNA、mRNA及較大RNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)測(cè)定已完成,如噬菌體MS2RNA含3569個(gè)核苷酸。

干擾機(jī)制

1990年,曾有科學(xué)家給矮牽牛花插入一種催生紅色素的基因,希望能夠讓花朵更鮮艷。但意想不到的事發(fā)生了:矮牽牛花完全褪色,花瓣變成了白色!科學(xué)界對(duì)此感到極度困惑。

類似的謎團(tuán),直到美國(guó)科學(xué)家安德魯·法爾和克雷格·梅洛發(fā)現(xiàn)核糖核酸RNA(核糖核酸)干擾機(jī)制才得到科學(xué)的解釋。兩位科學(xué)家也正是因?yàn)?998年做出的這一發(fā)現(xiàn)而榮獲2006年的諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)

上世紀(jì)八十年代,托馬斯.R.切赫博士在研究RNA的成熟體結(jié)構(gòu)中,發(fā)現(xiàn)了可以自我拼接的RNA催化作用(核糖核苷酸酶),并依此榮獲1989年諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)。經(jīng)過(guò)多年的深度研究,切赫博士在DNA基因遺傳過(guò)程中,發(fā)現(xiàn)了有趣的mRNA(信使RNA)和轉(zhuǎn)運(yùn)RNA(轉(zhuǎn)運(yùn)RNA),從而揭開了遺傳基因?qū)е?a href="/hebeideji/4251675820109199490.html">出生缺陷、大腦發(fā)育、營(yíng)養(yǎng)吸收、細(xì)胞變異以及健康長(zhǎng)壽等一系列人類生命密碼的神秘面紗。

mRNA(信使RNA)人類的遺傳信息主要貯存于脫氧核糖核酸堿基序列中,不過(guò)DNA并不直接決定蛋白質(zhì)的合成。而在真核生物中,DNA主要貯存于細(xì)胞核中的染色體上,而蛋白質(zhì)的合成場(chǎng)所存在于細(xì)胞質(zhì)中的核糖體上,因此需要有一種中介物質(zhì),才能把DNA上控制蛋白質(zhì)合成的遺傳信息傳遞給核糖體。切赫博士把這種起著傳遞遺傳信息作用的特殊RNA。稱為信使RNA(messenger RNA,mRNA)。

簡(jiǎn)單的說(shuō),mRNA就是為了完成基因表達(dá)過(guò)程中的遺傳信息傳遞。

令人遺憾的是,在遺傳轉(zhuǎn)錄形成的過(guò)程中,僅有25%序列經(jīng)加工成為mRNA,其余的均呈現(xiàn)非編碼序列的前體mRNA形式,這些形式的mRNA在分子大小上差別很大,是導(dǎo)致出生缺陷、大腦發(fā)育、營(yíng)養(yǎng)吸收、細(xì)胞變異以及健康長(zhǎng)壽等一系列問題的基因遺傳因素的關(guān)鍵所在。

切赫博士歷經(jīng)20年升華鉆研,成果破譯了mRNA編碼序列信息奧秘,通過(guò)特殊的生物干預(yù)手段,優(yōu)化mRNA的序列加工,篩查和剔除基因排列誘發(fā)基因和細(xì)胞突變的序列,不僅確保mRNA的序列加工的有效與增強(qiáng),而且從根本上避免不良基因傳遞或傳遞序列問題引發(fā)細(xì)胞突變等一系列遺傳問題的發(fā)生。

mRNA編碼序列信息的成果破譯,奠定了OMG配方鹽技術(shù)的可行性基礎(chǔ)。

法爾和梅洛的發(fā)現(xiàn)科學(xué)家在矮牽牛花實(shí)驗(yàn)中所觀察到的奇怪現(xiàn)象,其實(shí)是因?yàn)樯矬w內(nèi)某種特定基因“沉默”了。導(dǎo)致基因“沉默”的機(jī)制就是RNA干擾機(jī)制。

此前,RNA分子只是被當(dāng)作從脫氧核糖核酸(脫氧核糖核酸)到蛋白質(zhì)的“中間人”、將遺傳信息從“藍(lán)圖”傳到“工人”手中的“信使”。但法爾和梅洛的研究讓人們認(rèn)識(shí)到,RNA作用不可小視,它可以使特定基因開啟、關(guān)閉、更活躍或更不活躍,從而影響生物的體型和發(fā)育等。

諾貝爾獎(jiǎng)評(píng)審委員會(huì)在評(píng)價(jià)法爾和梅洛的研究成果時(shí)說(shuō):“他們的發(fā)現(xiàn)能解釋許多令人困惑、相互矛盾的實(shí)驗(yàn)觀察結(jié)果,并揭示了控制遺傳信息流動(dòng)的自然機(jī)制。這開啟了一個(gè)新的研究領(lǐng)域。”

siRNA的作用原理

RNA干涉(RNAi)在實(shí)驗(yàn)室中是一種強(qiáng)大的實(shí)驗(yàn)工具,利用具有同源性的雙鏈RNA(dsRNA)誘導(dǎo)序列特異的目標(biāo)基因的沉寂,迅速阻斷基因活性。siRNA在RNA沉寂通道中起中心作用,是對(duì)特定信使RNA(mRNA)進(jìn)行降解的指導(dǎo)要素。siRNA是RNAi途徑中的中間產(chǎn)物,是RNAi發(fā)揮效應(yīng)所必需的因子。siRNA的形成主要由Dicer和Rde-1調(diào)控完成。由于RNA病毒入侵、轉(zhuǎn)座子轉(zhuǎn)錄基因組反向重復(fù)序列轉(zhuǎn)錄等原因,細(xì)胞中出現(xiàn)了dsRNA,Rde-1(RNAi缺陷基因-1)編碼的蛋白質(zhì)識(shí)別外源dsRNA,當(dāng)dsRNA達(dá)到一定量的時(shí)候,Rde-1引導(dǎo)dsRNA與Rde-1編碼的Dicer(Dicer是一種RNaseIII活性核酸內(nèi)切酶,具有四個(gè)結(jié)構(gòu)域:Argonaute家族的PAZ結(jié)構(gòu)域,III型RNA酶活性區(qū)域,dsRNA結(jié)合區(qū)域以及DEAH/DEXHRNA解旋酶活性區(qū))結(jié)合,形成酶-dsRNA復(fù)合體。在Dicer酶的作用下,細(xì)胞中的單鏈靶mRNA(與dsRNA具有同源序列)與dsRNA的正義鏈互換,原來(lái)dsRNA中的正義鏈被mRNA代替而從酶-dsRNA復(fù)合物中釋放出來(lái),然后,在ATP的參與下,細(xì)胞中存在的一種RNA誘導(dǎo)的沉默復(fù)合體RNA-induced silencing complex(RISC,由核酸內(nèi)切酶、外切酶、解旋酶等構(gòu)成,作用是對(duì)靶mRNA進(jìn)行識(shí)別和切割)利用結(jié)合在其上的核酸內(nèi)切酶的活性來(lái)切割dsRNA上處于原來(lái)正義鏈位置的靶mRNA分子中與dsRNA反義鏈互補(bǔ)的區(qū)域,形成21-23nt的dsRNA小片段,這些小片段即為siRNA。RNAi干涉的關(guān)鍵步驟是組裝RISC和合成介導(dǎo)特異性反應(yīng)的siRNA蛋白。siRNA并入RISC中,然后與靶標(biāo)基因編碼區(qū)或UTR區(qū)完全配對(duì),降解靶標(biāo)基因,因此說(shuō)siRNA只降解與其序列互補(bǔ)配對(duì)的mRNA。其調(diào)控的機(jī)制是通過(guò)互補(bǔ)配對(duì)而沉默相應(yīng)靶位基因的表達(dá),所以是一種典型的負(fù)調(diào)控機(jī)制。siRNA識(shí)別靶序列是有高度特異性的,因?yàn)榻到馐紫仍谙鄬?duì)于siRNA來(lái)說(shuō)的中央位置發(fā)生,所以這些中央的堿基位點(diǎn)就顯得極為重要,一旦發(fā)生錯(cuò)配就會(huì)嚴(yán)重抑制RNAi的效應(yīng)。

RNA干擾技術(shù)的前景

RNA干擾技術(shù)不僅是研究基因功能的一種強(qiáng)大工具,不久的未來(lái),這種技術(shù)也許能用來(lái)直接從源頭上讓致病基因“沉默”,以治療癌癥甚至艾滋病,在農(nóng)業(yè)上也將大有可為。從這個(gè)角度來(lái)說(shuō),“沉默”真的是金。美國(guó)哈佛醫(yī)學(xué)院研究人員已用動(dòng)物實(shí)驗(yàn)表明,利用RNA干擾技術(shù)可治愈實(shí)驗(yàn)鼠的肝炎

盡管尚有一些難題阻礙著RNA干擾技術(shù)的發(fā)展,但科學(xué)界普遍對(duì)這一新興的生物工程技術(shù)寄予厚望。這也是諾貝爾獎(jiǎng)評(píng)審委員會(huì)為什么不堅(jiān)持研究成果要經(jīng)過(guò)數(shù)十年實(shí)踐驗(yàn)證的“慣例”,而破格為法爾和梅洛頒獎(jiǎng)的原因之一。

諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)評(píng)審委員會(huì)主席戈蘭·漢松說(shuō):“我們?yōu)橐环N基本機(jī)制的發(fā)現(xiàn)頒獎(jiǎng)。這種機(jī)制已被全世界的科學(xué)家證明是正確的,是給它發(fā)個(gè)諾貝爾獎(jiǎng)的時(shí)候了。”

轉(zhuǎn)錄

轉(zhuǎn)錄是指脫氧核糖核酸的雙鏈解開,使RNA聚合酶可依照DNA上的堿基序列合成相對(duì)應(yīng)之信使RNA(mRNA)的過(guò)程.在人體需要酵素或是蛋白質(zhì)時(shí),都會(huì)需要進(jìn)行此過(guò)程,才能借由信使mRNA,將密碼子帶出核模外.好讓核糖體進(jìn)一步的利用信使RNA(mRNA)來(lái)翻譯,合成所需之蛋白質(zhì)?DNA的堿基有A(6-氨基嘌呤)、G(鳥嘌呤)、C(胞嘧啶)、T(胸腺嘧啶),而RNA之堿基無(wú)T(胸腺嘧啶),取而代之的是U(尿嘧啶),也就是有A(腺嘌呤)、G(鳥嘌呤)、C(胞嘧啶)、U(尿嘧啶).在脫氧核糖核酸中,A與T以兩條氫鍵連結(jié),G與C以三條氫鍵連結(jié),但RNA只有U而無(wú)T,所以在轉(zhuǎn)錄時(shí)DNA上的若是A,mRNA就會(huì)是U,也就是取代原本T的位置?如下圖所示,右邊DNA的一股堿基序列若為‘AAACCG’,而左方的DNA因聯(lián)會(huì)而就會(huì)成‘TTTGGC’,但因RNA無(wú)T這個(gè)堿基,只有U,因此合成出來(lái)的mRNA對(duì)應(yīng)之序列就為‘UUUGGC’因?yàn)镈NA太大,無(wú)法出入核膜細(xì)胞核的膜),所以才需要有mRNA的出現(xiàn),讓mRNA可穿過(guò)核孔(核膜上的孔洞)到達(dá)細(xì)胞質(zhì)進(jìn)行翻譯(核糖體合成蛋白質(zhì)的過(guò)程),因此,轉(zhuǎn)錄對(duì)不管是人類還是動(dòng)物甚至是細(xì)菌都是不可或缺的重要反應(yīng)。

翻譯

游離在細(xì)胞質(zhì)中的各種氨基酸,就以mRNA為模版合成具有一定氨基酸順序的蛋白質(zhì),這一過(guò)程叫翻譯。

首先氨基酸與轉(zhuǎn)運(yùn)RNA結(jié)合生成氨-tRNA

然后是多肽鏈的起始:mRNA從核到胞質(zhì),在起始因子和Mg的作用下,小亞基與mRNA的起始部位結(jié)合,甲硫氨酰(甲硫氨酸)—tRNA的反密碼子,識(shí)別mRNA上的起始密碼AuG(mRNA)互補(bǔ)結(jié)合,接著大亞基也結(jié)合上去,核糖體上一次可容納二個(gè)密碼子。(原核生物中為甲酰甲硫氨酰

再是多肽鏈的延長(zhǎng):第二個(gè)密碼對(duì)應(yīng)的氨酰基—tRNA進(jìn)入核糖體的A位,也稱受位,密碼與反密碼的氫鍵,互補(bǔ)結(jié)合。在大亞基上的多肽鏈轉(zhuǎn)移酶(轉(zhuǎn)肽酶)作用下,供位(P位)的轉(zhuǎn)運(yùn)RNA攜帶的氨基酸轉(zhuǎn)移到A位的氨基酸后并與之形成肽鍵(—CO-NH—),tRNA脫離P位并離開P位,重新進(jìn)入胞質(zhì),同時(shí),核糖體沿mRNA往前移動(dòng),新的密碼又處于核糖體的A位,與之對(duì)應(yīng)的新氨基酰-tRNA又入A位,轉(zhuǎn)肽鍵把二肽掛于此氨基酸后形成三肽,ribosome又往前移動(dòng),由此漸進(jìn)漸進(jìn),如此反復(fù)循環(huán),就使mRNA上的核苷酸順序轉(zhuǎn)變?yōu)榘被岬呐帕许樞颉?/p>

最后是多肽鏈的終止與釋放:肽鏈的延長(zhǎng)不是無(wú)限止的。當(dāng)mRNA上出現(xiàn)終止密碼時(shí)(UGA、U氨基酸和UGA),就無(wú)對(duì)應(yīng)的氨基酸運(yùn)入核糖體,肽鏈的合成停止,而被終止因子識(shí)別,進(jìn)入A位,抑制轉(zhuǎn)肽酶作用,使多肽鏈與轉(zhuǎn)運(yùn)RNA之間水解脫下,順著大亞基中央管全部釋放出,離開核糖體。同時(shí)大小亞基與mRNA分離,可再與mRNA起始密碼處結(jié)合,也可游離于胞質(zhì)中或被降解,mRNA也可被降解。

自身調(diào)控

2013年5月新一期《科學(xué)》雜志上報(bào)告說(shuō),英國(guó)約翰·英尼斯中心的研究人員發(fā)現(xiàn)的這種核糖核酸名為COOLAIR,是一種反義長(zhǎng)鏈非編碼核糖核酸。研究人員以模式植物擬南芥作為研究對(duì)象,通過(guò)遺傳篩選和基因克隆等手段,發(fā)現(xiàn)COOLAIR受到一種叫做R環(huán)的特殊結(jié)構(gòu)的影響。R環(huán)是由一條脫氧核糖核酸(DNA)與核糖核酸雜合鏈以及一條單鏈DNA所形成的特殊基因組結(jié)構(gòu),一般在基因表達(dá)轉(zhuǎn)錄核糖核酸時(shí)可以形成瞬時(shí)的R環(huán),但很快會(huì)被去除。而他們觀察發(fā)現(xiàn),R環(huán)能夠通過(guò)抑制COOLAIR發(fā)揮作用,從而讓擬南芥提前開花。

研發(fā)

2021年5月,中科院發(fā)現(xiàn)基因魔剪新系統(tǒng),被廣泛地應(yīng)用于RNA敲低、RNA單堿基編輯、RNA定點(diǎn)修飾、RNA活細(xì)胞示蹤以及核酸檢測(cè)領(lǐng)域。

功能

mRNA

mRNA含A、U、G、C四種核苷酸,每三個(gè)相聯(lián)而成一個(gè)三聯(lián)體,即密碼,代表一個(gè)氨基酸的信息,故按數(shù)學(xué)中排列組合法則計(jì)算,可形成43=64個(gè)不同的密碼。

64個(gè)密碼中,61個(gè)密碼分別代表各種氨基酸。每種氨基酸少的只有一個(gè)密碼,多的可有6個(gè),但以2個(gè)及4個(gè)的居多數(shù)。此外,UAA、UAG、UGA這三個(gè)密碼是肽鏈合成的終止信號(hào),不代表任何氨基酸。在真核生物中,AUG既是甲硫氨酸的密碼,又是肽鏈合成的起始信號(hào);而在原核生物中,GUG(在真核生物中是氨酸的密碼)和AUG樣,都是甲酰甲硫氨酸的密碼和肽鏈合成的起始相號(hào)。可見,除GUG外,所有的密碼從細(xì)菌到高等生物都能適用,這一點(diǎn)為生物的共同起源學(xué)說(shuō)提供了有力的佐證。

必須指出:⑨在mRNA整個(gè)分子中,從起始信號(hào)直至終止信號(hào),其密碼的三聯(lián)體是連續(xù)的,密碼與密碼之間沒有間隔的核苷酸;②起始信號(hào)AUG并非是mRNA的起始(5′端),而可以和5′端間隔若干個(gè)核苷酸;而且終止信號(hào)也不在mRNA的3′端。

tRNA

作為“搬運(yùn)工具”的轉(zhuǎn)運(yùn)RNA有很多種,體內(nèi)20種氨基酸都有其自已特有的tRNA,所以,tRNA的種類不少于20種。tRNA在ATP供應(yīng)能量和酶的作用下,可分別與特定的氨基酸結(jié)合。每個(gè)tRNA都有一個(gè)由三個(gè)核苷酸編成的“反密碼”。這個(gè)反密碼可以根據(jù)堿基配對(duì)的原則與mRNA上對(duì)應(yīng)的密碼配對(duì),而且只有當(dāng)反密碼與mRNA上的密碼相對(duì)應(yīng)時(shí)才能配合,否則就“格格不入”。所以在翻譯時(shí),帶著不同氨基酸的各個(gè)tRNA就能準(zhǔn)確地在mRNA分子上“對(duì)號(hào)入座”,依次與典密碼相合,這就保證了氨基酸能排列成一定的順序。

轉(zhuǎn)運(yùn)RNA上的反密碼當(dāng)然應(yīng)能識(shí)別mRNA上相應(yīng)的、互補(bǔ)的密碼,并與之配對(duì)。然而用提純的tRNA來(lái)進(jìn)行實(shí)驗(yàn)時(shí),發(fā)現(xiàn)一種tRNA能夠識(shí)別幾種密碼。例如,丙氨酸t(yī)RNA,其反密碼為IGC(5′>3′),可以識(shí)別三種密碼。

rRNA

rRNA與多種蛋白質(zhì)分子共同構(gòu)成核蛋白體。核蛋白體相當(dāng)于“裝配機(jī)”,能促使tRNA所攜帶的氨基酰基縮合成肽。核蛋白體附著在mRNA上,并沿著mRNA長(zhǎng)鏈的起始信號(hào)向終止信號(hào)移動(dòng)。至于rRNA在蛋白質(zhì)生物合成中的具體作用還不清楚。

參考資料 >

中科院發(fā)現(xiàn)基因魔剪新系統(tǒng),有望助力RNA基因治療_綠政公署_澎湃新聞-The Paper.綠政公署_澎湃新聞-The Paper.2021-05-04

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