哲布尊丹巴呼圖克圖，簡稱哲布尊丹巴，是漠北蒙古藏傳佛教最大的活佛世系，屬格魯派，于17世紀初形成，與內蒙古自治區的章嘉呼圖克圖并稱為蒙古族地區兩大活佛。
哲布尊丹巴世系的確立
十六世紀，藏傳佛教格魯派傳入蒙古族地區，到十七世紀中葉，已經廣泛傳播于大部分蒙古族地區。喀爾喀蒙古族汗王派人赴藏，要求西藏自治區派高僧前去傳播佛教。1614年（明萬歷四十二年），覺囊派高僧多羅那他被外蒙古高原諸汗王迎請到烏蘭巴托，并被尊稱為“哲布尊丹巴”。1634年（明崇禎七年），多羅那他在庫倫去世。次年，土謝圖汗部王妃生一子，被確認為多羅那他的轉世，法號曲卡·羅桑丹貝堅贊，立其為法王。順治六年（1649），羅桑丹貝堅贊赴西藏學法。七年（1650），羅桑丹貝堅贊從四世班禪喇嘛羅桑·卻吉堅贊受戒，并覲見了格魯派領袖五世達賴喇嘛阿旺羅桑嘉措，兩人均要求其改宗，作為正式承認其活佛地位的條件。在固始汗的扶植下，八年（1651），羅桑丹貝堅贊由覺囊派改宗格魯派，達賴承認其為第一世哲布尊丹巴。從此開始了哲布尊丹巴活佛系統。
順治十四年（1657），曲卡·羅桑丹貝堅贊回蒙古高原傳法，駐喀爾喀土謝圖汗部之額爾德尼召（光顯寺），逐漸成為蒙古高原各部的宗教領袖。康熙二十七年（1688），青海喀爾喀部受準噶爾汗國噶爾丹策零的攻擊，羅桑丹貝堅贊率喀爾喀三汗所屬部眾臣服于清朝。三十年（1691），愛新覺羅·玄燁冊封其為呼圖克圖大喇嘛，統管蒙古喀爾喀部宗教事務。此后，按慣例，哲布尊丹巴活佛系統的傳承需受到清朝皇帝的冊封才具有效力。
近當代的情況
1911年10月，辛亥革命爆發，八世哲布尊丹巴博克多格根在俄羅斯帝國的支持下于12月28日宣布外蒙古獨立，任日光皇帝“額真汗”，改元共戴。1915年，哲布尊丹巴取消獨立，受袁世凱政府冊封為呼圖克圖汗，保持了自治王公的地位。1919年，北洋政府徐樹錚趁十月革命之后俄羅斯帝國內戰之際，率軍隊進占烏蘭巴托，取消外蒙古自治。1921年，蒙古人民革命黨在蘇聯紅軍的協助下擊敗白俄軍隊，奪取蒙古政權，7月10日哲布尊丹巴成為立憲君主。1924年，八世哲布尊丹巴博克多格根于庫倫突然圓寂，人民革命黨政府（政權）宣布不再尋找轉世靈童，11月24日建立蒙古，開始限制和控制藏傳佛教信仰（立法禁止尋找轉世）。該世系在外蒙古終結。
其后，在土登嘉措的主持下，西藏自治區僧侶在藏區秘密進行了尋找哲布尊丹巴博克多格根轉世靈童的儀式，在1936年確認蔣巴南卓（1932年11月10日出生于拉薩大昭寺附近）為哲布尊丹巴轉世。
哲布尊丹巴世系表
一世：哲布尊丹巴一世（1635年―1723年）
二世：哲布尊丹巴·羅布丹彬多密（1724年―1757年）
三世：哲布尊丹巴·伊什丹巴尼瑪（1758年―1773年）
四世：哲布尊丹巴·羅布藏圖巴坦旺舒克（1775年―1813年）
五世：哲布尊丹巴·羅布藏楚都木濟克默特（1815年―1842年）
六世：哲哲布尊丹巴·羅布藏巴勒墊丹拜佳木粲（1842年―1848年）
七世：哲布尊丹巴·凱珠布丹桑（1850年―1869年）
八世：哲布尊丹巴·博克多格根（1869年―1924年）
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