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糖組學(xué)
來源:互聯(lián)網(wǎng)

糖組學(xué)(英語:Glycomics)又稱糖體學(xué),是綜合研究糖組(糖的全部補(bǔ)體,無論是游離存在的還是在生物體的更復(fù)雜的分子中存在的),包括遺傳、生理、病理等方面的一門學(xué)科。糖組學(xué)是給定細(xì)胞類型或生物體的所有聚糖結(jié)構(gòu)的系統(tǒng)研究,并且是糖生物學(xué)的一個(gè)子集。該學(xué)科涉及蛋白質(zhì)糖鏈組成及功能的研究,尋找疾病相關(guān)阿斯巴甜基化修飾規(guī)律,分析糖蛋白糖鏈和糖結(jié)合蛋白相互作用的關(guān)聯(lián)性,探討糖類相關(guān)基因和糖結(jié)合蛋白基因調(diào)控糖蛋白糖鏈和糖結(jié)合蛋白合成的機(jī)制。

學(xué)科介紹

功能糖組學(xué)實(shí)驗(yàn)室主要研發(fā)功能糖組學(xué)相關(guān)技術(shù)和方法,用于疾病相關(guān)糖類基因、糖蛋白和糖結(jié)合蛋白的研究。糖組學(xué)的研究內(nèi)容不僅包括糖蛋白糖鏈的研究,還涉及甲型流感病毒蛋白糖基化與毒力以及宿主特異性的關(guān)系。與蛋白質(zhì)組學(xué)類似,糖組并不穩(wěn)定,取決于細(xì)胞等環(huán)境條件。

面臨的挑戰(zhàn)

糖組學(xué)面臨的挑戰(zhàn)包括糖的復(fù)雜性,它們的結(jié)構(gòu)不是線性的,而是高度分枝,且聚糖可以被修飾,這增加了它的復(fù)雜性。聚糖的生物合成途徑復(fù)雜,通常與蛋白質(zhì)(糖蛋白)或脂質(zhì)(糖脂)結(jié)合。與基因組不同,聚糖具有很強(qiáng)的動(dòng)態(tài)性。糖組學(xué)研究領(lǐng)域必須處理在其他應(yīng)用生物學(xué)領(lǐng)域尚未見到的固有的復(fù)雜程度。68個(gè)構(gòu)建單元為構(gòu)成細(xì)胞整個(gè)生命的分子編排提供了結(jié)構(gòu)基礎(chǔ),其中糖類有32種類型的糖鍵,可以排列成用于糖的分支陣列,進(jìn)一步提高了復(fù)雜程度。此外,所涉及的眾多蛋白質(zhì)的復(fù)雜性不僅僅是碳水化合物的載體,糖蛋白,而是特異性參與與碳水化合物反應(yīng)的蛋白質(zhì),如用于合成、調(diào)節(jié)和降解的碳水化合物特異性酶,凝集素,以及各種碳水化合物結(jié)合蛋白和受體。

使用的工具

糖組學(xué)研究中常用的技術(shù)包括高分辨質(zhì)譜法(MS)和高效液相色譜法(HPLC)。這些方法通常涉及將聚糖部分從目標(biāo)物酶的或化學(xué)的裂解并進(jìn)行分析。在糖脂的情況下,它們可以直接分析而不分離脂質(zhì)成分。糖組學(xué)研究者可以利用幾種在線軟件和數(shù)據(jù)庫,如GlycomeDB和UniCarb-DB,這些工具為糖組學(xué)研究提供了重要的信息資源和分析平臺(tái)。

參考資料 >

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