按照《重慶市機構改革方案》要求，重慶組建市生態環境局。將原重慶市環境保護局的職責，以及重慶市發展和改革委員會的應對氣候變化和減排職責，重慶市國土資源和房屋管理局的監督防止地下水污染職責，重慶市水利局的編制水功能區劃、排污口設置管理、流域水環境保護職責，重慶市農業委員會的監督指導農業面源污染治理職責等整合，組建重慶市生態環境局，作為重慶市政府組成部門。不再保留市環境保護局。
2018年10月23日，重慶市生態環境局正式掛牌亮相。
主要職責
一、負責貫徹執行國家生態環境基本制度。負責貫徹執行生態環境法律法規、規章、標準和方針政策，起草生態環境地方性法規、政府規章草案，根據職責和授權擬訂有關法規的實施細則和規范性文件，組織擬訂地方生態環境標準和技術規范。會同有關部門擬訂生態環境政策、規劃并組織實施。會同有關部門編制并監督實施重點區域、流域、飲用水水源地生態環境規劃和水功能區劃。
二、負責重大生態環境問題的統籌協調和監督管理。建立健全突發生態環境事件的應急預警機制。牽頭協調重特大環境污染事故和生態破壞事件的調查處理，指導協調區縣（自治縣）政府對較大及以上突發生態環境事件的應急、預警工作。牽頭指導和實施生態環境損害賠償制度，協調解決有關跨區域的環境污染糾紛。統籌協調重點區域、流域生態環境保護工作。
三、負責監督管理減排目標的落實。監督實施各類污染物排放總量控制、排污許可證制度，組織確定水、大氣等納污能力，監督檢查污染物減排任務完成情況，實施生態環境保護目標責任制。
四、負責提出生態環境領域固定資產投資規模和方向、財政性資金安排的意見，配合有關部門做好組織實施和監督工作。
五、負責環境污染防治的監督管理。擬訂水、大氣、土壤、固體廢物、化學品、機動車、噪聲、光、惡臭等污染防治管理制度并監督實施。會同有關部門監督管理飲用水水源地生態環境保護工作，負責流域水環境保護，監督防止地下水污染。負責入河排污口的設置管理。組織指導城鄉生態環境綜合整治工作，監督指導農業面源污染治理工作。監督指導區域大氣環境保護工作，組織實施區域空氣污染聯防聯控協作機制。
六、指導協調和監督生態保護修復工作。組織編制生態保護規劃，監督對生態環境有影響的自然資源開發利用活動、重要生態環境建設和生態破壞恢復工作。組織擬訂各類自然保護地生態環境監管制度并監督執法。監督野生動植物保護、濕地生態環境保護、荒漠化防治等工作。指導協調和監督農村生態環境保護工作。監督生物技術環境安全，牽頭生物物種（含遺傳資源）工作，組織協調生物多樣性保護工作。參與生態保護補償工作。
七、負責核與輻射安全的監督管理。牽頭負責核安全工作協調機制有關工作。監督管理核安全和放射源安全，監督管理電磁輻射、核技術應用、伴有放射性礦產資源開發利用中的污染防治。組織開展核與輻射環境監測工作。負責輻射環境事故應急處理，參與核事故應急處理。
八、負責生態環境準入的監督管理。受市政府委托對重大經濟和技術政策、發展規劃以及重大經濟開發計劃進行環境影響評價，按規定審批或審查重大開發建設區域、規劃、項目環境影響評價文件，組織實施生態環境準入清單。
九、負責生態環境監測工作。擬訂生態環境監測制度、規范和相關標準并監督實施。組織建設和管理生態環境監測網、生態環境信息網，會同有關部門統一規劃生態環境質量監測站點設置。組織實施生態環境質量監測、污染源監督性監測、溫室氣體減排監測、應急監測。組織開展生態環境質量狀況調查評價、預測預警。建立和實行生態環境質量公告制度，統一發布生態環境質量狀況和重大生態環境信息。
十、負責應對氣候變化工作。貫徹執行應對氣候變化及溫室氣體減排重大戰略、規劃和政策，承擔國家履行聯合國氣候變化框架公約在我市的相關工作，組織開展應對氣候變化國際交流與合作。
十一、組織開展生態環境保護督察。負責建立健全生態環境保護督察制度，對接中央生態環境保護督察有關工作，組織協調市級生態環境保護督察工作，根據授權對區縣（自治縣）、有關部門貫徹落實生態環境保護決策部署情況進行督察問責。
十二、負責生態環境監督執法。組織開展生態環境保護執法檢查活動，查處重大生態環境違法問題，以及跨區域、跨流域的生態環境違法問題，具體執法交由相關執法隊伍承擔，并以部門名義統一執法，指導區縣（自治縣）生態環境保護執法工作。
十三、負責開展生態環境科技工作。組織開展生態環境科學研究和技術工程示范，推動生態環境技術管理體系建設。參與指導推動循環經濟和生態環保產業發展。
十四、組織開展生態環境宣傳教育與國際合作工作。制定并組織實施生態環境保護宣傳教育綱要，推動社會組織和公眾參與生態環境保護。組織開展生態環境國際合作交流，組織協調有關生態環境國際條約在我市的履約工作。
十五、承擔重慶市生態環境委員會的日常工作。
十六、負責機關、直屬單位和主管的社會組織黨建工作。
十七、完成市委、市政府交辦的其他任務。
十八、職能轉變。重慶市生態環境局要統一行使生態和城鄉各類污染排放監管與行政執法職責，切實履行監管責任，全面落實水、大氣、中華人民共和國土壤污染防治法行動計劃。構建政府為主導、企業為主體、社會組織和公眾共同參與的生態環境治理體系，實行最嚴格的生態環境保護制度，嚴守生態保護紅線和環境質量底線，堅決打好污染防治攻堅戰，保障生態安全，建設山清水秀美麗之地。
內設機構
辦公室（應急管理辦公室）
重慶市生態環境保護督察辦公室
綜合處
法規處
組織人事處
財務審計處
科技標準處
自然生態保護處
水生態環境處
大氣環境處
土壤生態環境處
固體廢物與化學品處
核與輻射安全管理處
環境影響評價處（行政審批處）
總量與排放管理處（應對氣候變化處）
生態環境監測處
宣傳教育和國際合作處
生態環境督察一處
生態環境督察二處
生態環境督察三處
生態環境督察四處
直屬機關黨委辦公室
離退休人員工作處
所獲榮譽
2019年生態環境保護執法大練兵中，重慶市生態環境局在省級組織中排名第4位，被評審為表現突出組織單位。
2020年3月，獲得生態環境部2019年生態環境保護執法大練兵省級表現突出組織單位表揚。
2021年6月25日，重慶市生態環境局固體廢物與化學品處黨支部被表彰為“市直機關先進基層黨組織”。
參考資料 >
重慶市生態環境局主要職責.重慶市生態環境局.2022-08-11
內設機構.重慶市生態環境局.2022-08-11
2019 年生態環境保護執法大練兵 省級組織單位評審結果.中華人民共和國生態環境部.2020-08-16
關于表彰市直機關優秀共產黨員、優秀黨務工作者和先進基層黨組織的決定（2021年6月25日）.重慶市人民政府.2021-11-11