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衛軍民指揮使司，明朝官署名。明代在西部邊疆及西南腹地少數民族聚集地區設立了多個衛軍民指揮使司，職兼軍民，既參與軍事事務，又處理民政事務，是明朝一種比較特殊的地方行政建置。
機構職責
衛軍民指揮使司，融合了衛所和府州的功能，既管轄軍戶，處理衛內軍務，也兼轄民戶，處理民政事務，同時下轄當地土司機構。主要負責維護明朝在西部少數民族聚集地區的統治。
歷史沿革
明朝洪武十二年（1379）七月，改陜西河州右衛指揮使司為河州衛軍民指揮使司，同時裁撤河州府，成為歷史上首個衛軍民指揮使司。
此后一直到正統年間，明朝在陜西省、湖廣、云貴高原、四川省、廣西壯族自治區等少數民族聚集地區陸續設立了二十余個衛軍民指揮使司。
明朝中后期曾大量調整和裁撤衛軍民指揮使司，到清朝罷衛所制時徹底罷撤。
部門設置
其設官同衛指揮使司，有指揮使、指揮同知、指揮事、鎮撫、經歷、知事等官，又設撫夷同知、儒學教授、訓導等文職。下轄各千戶所以及土司機構。
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