莖刺藻科（學名：Caulacanthaceae）為杉藻目的一個科。
果胞枝2~5個細胞，輔助細胞受精后發育；囊果埋在藻體內，果孢子囊產于一個大的淺裂的融合胞，隆起的皮層作用為一囊果被，囊果有開孔。藻體圓柱形或扁平，放射分枝或兩側分枝。髓部絲狀體，皮層細胞緊密，放射排列，內層較大，外層較小并含有豐富的色素體。四分孢子囊層形分裂，散生在藻體的外皮層中。
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